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代谢组学数据工作站(分子模拟与人工智能平台)(GY202306425)采购公告
发布日期：2023-11-06 来源：本站 浏览数：100 人
代谢组学数据工作站（分子模拟与人工智能平台）（GY202306425）采购公告
| 项目名称 | 代谢组学数据工作站（分子模拟与人工智能平台） | 项目编号 | GY202306425 |
| 公告开始日期 | 2023-11-03 18:54:20 | 公告截止日期 | 2023-11-08 19:00:00 |
| 采购单位 | 微生物技术研究院（国家重点实验室） | 付款方式 | 货到验收合格后付款 |
| 联系人 | 成交后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 成交后在我参与的项目中查看 |
| 签约时间要求 | 成交后5个工作日内 | 到货时间要求 | 签订合同后30天内 |
| 预算总价 | ￥ 250,000.00 + + 未公布 | ||
| 收货地址 | 山东大学青岛校区 | ||
| 供应商资质要求 |
符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 |
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| 公告说明 | |||
采购清单1
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
| 代谢组学数据工作站（分子模拟与人工智能平台） | 1 | 套 | 服务器 无 无 |
| 品牌 品牌1 | Thermo Fisher Scientific |
| 型号 | Compound Discoverer |
| 品牌2 | |
| 型号 | |
| 品牌3 | |
| 型号 | |
| 预算单价 | ￥ 250,000.00 |
| 技术参数及配置要求 |
一、软件 1、应用领域 适用于已知和完全未知物的非目标筛查、定性以及统计学分析。提供了丰富的功能模块，定制化组合为核心的流程化设计，具有良好的灵活性与可拓展性。 “一键”实现从原始数据处理、结构鉴定到代谢通路分析。适用于环境和食品安全研究、食品科学、代谢/脂质组学、代谢流、中药和天然产物、药物代谢、杂质分析、降解产物分析、E&L分析以及法医毒理学等分析。 2、主要功能 软件主要分为两部分功能，其一为非目标性的筛查、定性及差异性分析；以及目标性物质分析，如给定母药的药物代谢、杂质分析等。部分功能阐释如下： 2.1.非目标性的筛查、定性及差异性分析 软件有丰富的应用模板，集成色谱峰对齐、峰提取、填充缺失值、归一化、统计学分析、化合物鉴定等功能。具有多种标准品及网络数据库资源，以及在线和本地的通路数据库，可根据分析需求单独或者组合使用。 2.1.1提峰并鉴定未知物 软件一键式对色谱峰中所有组分进行提取，并使用标准品数据库mzCloud？、ChemSpider、MassBank或自建mzVault标准品数据库进行数据库搜索。数据库资源包括：（1）标准品数据库：mzCloud？及自建mzVault标准品数据库，其中mzCloud？目前包含内源性物质、药物、食品安全等覆盖17个不同应用方向，提供＞20,043个化合物，＞9,216,948张图谱，＞25,174种化合物碎裂路径 ，且在不断更新；（2）NIST LC-MS/MS数据库；（3）MassBank等公开资源谱图数据库；（4）ChemSpider数据库，包含1.14亿种化合物资源，软件的搜索引擎可以做到在线快速搜库，鉴定未知分析物。 2.1.2样本间统计学分析 针对不同处理处理或表型的样本，快速找出不同样本组之间的统计学差异。使用交互式链接显示查看研究中的成分趋势，寻找并鉴定多个样本组之间的差异性成分，通过添加标签、过滤等方式结合多种统计学分析结果快速筛选潜在的目标性组分。 2.1.3生物学通路分析 集成了Metabolika、KEGG和BioCyc网络数据库，在代谢组学、脂质组学、代谢流分析中，进行代谢通路分析，并可交互式查看通路分析的结果。 2.2.目标性物质的代谢产物、杂质分析 集成了给定母药的药物代谢、杂质分析等流程。包含目前常见的I相和II相transformation形式，并可通过dealkylation/diarylation功能，碎片和母药间相关性等手段，针对已知transformation的目标性代谢物、杂质进行分析；同时可以通过质量亏损过滤、母药碎片搜索、特征同位素分布模式等功能对“未知”的代谢物、杂质进行查找。 2.3.工作流程化，简单易上手（自带模板） 2.3.1.工作流程模块化 软件基于节点（node）式设计，可根据不同的应用特点组合为丰富的应用模板（workflow），用户可方便地调用模板直接分析，目前已有12个不同应用方向近50个workflow可用。 2.3.2.用户自定义模板 针对特殊的应用方向，用户可用灵活的组合所需要的节点。拖放式的编辑模式可轻松将节点集成至一个完整的workflow中。并可在单次数据处理中将目标性和非目标性分析结合，灵活地选择如何处理数据，针对用户个性化研究方向进行更加精确的分析，以得到更为准确的结果。 2.4.数据结果展示 软件分析完成后，可生成多个列表，包含Compounds、Features、搜索不同数据库的结果、统计学分析方法等，并可快速筛选对分析最有意义的数据，不同的结果展示方式也使数据查看更简单高效。 2.4.1强大而灵活的结果表格筛选，带有自动隐藏背景功能 各个列表间相互链接并综合在Compounds列表中，能够方便地显示化合物的保留时间、化合物注释结果、统计学分析结果、相关代谢通路、峰形评价得分、峰面积等等。 2.4.2丰富的结果展示方式 提供诸如峰面积、RSD、MS2等的直方图、饼图等数据统计。同时提供主成分分析、聚类分析等多种统计学分析方式，并通过PCA得分图、载荷图、火山图、交互式聚类分析热图、PLS-DA、箱线图和趋势线图等多种展示方式，更高效地进行数据分析。 2.4.3显示质谱树与碎片注释，提供阐明结构的路径 软件的化合物注释结果中，采用mzCloud？和mzVault标准品数据库进行分析，并提供匹配分数，增加化合物注释结果的可信度。标准品数据库匹配的结果以镜像图的形式进行展示，并可将mzCloud？数据库中碎片信息展示在镜像图上。针对不在数据库中的物质，可以通过FISh Scoring功能，自动生成理论碎片并和采集的数据进行匹配，理论的碎片同样可展示在碎片图中。 3、特点 3.1.代谢流分析 软件可以进行非靶向的代谢流分析。针对完全无目标通路的代谢流分析，可以通过数据库鉴定未知物等手段完成。提供代谢物标记的元素的个数、标记的量、以及交互式的代谢通路分析等结果。 3.2.算法 利用MS2相似性搜索手段。首先从 mzCloud？数据库916万张谱图中获得最相似的谱图，并获得相应的碎片结构信息，再采用结构相似性算法，最大程度的解释ChemSpider搜索匹配的结构，对候选化合物进行智能排序，提升化合物注释结果的数量和可信度。 3.3.分子网络功能 分子网络（Molecular Networking）分析，旨在可视化样品中化合物与化合物间的相似性。Molecular Networking算法通过已知的代谢途径，以及MS2谱图的相似性，获得分子间的相互关系，从而为新化合物的鉴定提供可能性。主要在中药、药物杂质、药物代谢、毒品以及环境领域的新化合物的发现。 3.4.全新的峰检测算法，峰质量评价指数 Peak Rating通过评估色谱峰的峰形、色谱峰/基线比等四维参数，最大化地进行峰检测，从而获得更多的色谱峰信息，避免峰丢失。并通过预置的峰面积、峰形、CV等参数对提到的峰进行打分。可以快速的保留高质量的色谱峰，提升提峰的准确性和运算速度。 3.5.基于QC样本的峰面积校正和归一化 软件引入了基于QC样本进行峰面积校正的方法，同时引入了基于随机森林的缺失值填充，以及多批次QC样本的系统误差校正（SERRF）等功能；此外，增加了包括峰面积总和（Sum）或中位数（Median）等4种选择的归一化方法，增强大队列分析的能力，提高结果的准确性。 3.6.功能汇总 包含(1)全新的峰检测算法、峰质量评级计算和过滤功能、(2)ChromAlign节点方法、(3)新的Search mzCloud？节点功能（使用采集的MSn的多级数据搜索整个mzCloud？数据库的质谱树，计算MS2和MSn质谱树的匹配分值，还可以在 Compounds表中检索和显示Meta数据）。 3.7.增强的功能： (1)分子网络功能的改进，(2)支持多个质量范围的数据处理，(3)支持使用FAIMS多个CV值的数据处理，(4)自定义标签并可导入和导出自定义的标签，(5)自动导出结果功能，（6）在报告中显示mzCloud？镜像图、Study和结果文件名、新增脂质数据库，（7）“Grouping & Ratios”选项卡显示所选组和比率的统计检验信息，（8）新增“Statistical Methods”表格，增加transformations、statistical tests、 scaling methods、gap filling以及使用的基于QC样本的峰面积校正和归一化方法，（9）改进GC/MS的工作流程。 4、售后服务与培训 4.1. 一年内免费提供软件安装服务。 4.2. 一年内免费提供软件使用的应用培训。 二、工作站 型号：戴尔Precision 7920 Tower 外观：塔式 主板: 戴尔7920工作站主板 CPU： 双 英特尔？至强？金牌 6230R (35.75MB 缓存, 26 核, 52 线程, 2.10 GHz 至 4.00 GHz Turbo, 150W) 散热器：2*CPU clip, 已装配 CPU含散热器 机箱：Precision T7920 机箱 EPEAT (BC_PCIe) CL, 含 中国 TPM 内存：128GB（2x64GB）DDR4 3200MHz RDIMM ECC 内存 硬盘：M.2 1TB PCIe NVMe Class 40 固态硬盘 + 6个*3.5" 戴尔8TB 7200rpm SATA 硬盘 AG-企业 Class + 1个*3.5" 4TB 7200rpm SATA 戴尔品牌企业工作站级存储硬盘 硬盘控制器：线缆组件 1-2 HDD 前置 FlexBay NVMe PCIe SSD； 英特尔集成控制器 (RST-e) 适用于 1-2 前置 FlexBay NVMe 盘； 显卡：A2000 6G 网卡：集成网卡 电源：1400W 显示器：2个*戴尔（DELL）27英寸 4K显示器 IPS 内置音箱 旋转升降 FreeSync 电脑显示屏 S2721QS 防蓝光版 服务：戴尔原厂3年全保 ProSupport:(7x24) 下一工作日上门服务 键鼠：戴尔原厂有线键盘鼠标 货期：签订合同后1个月内 |
| 售后服务 | 质保期限:1年; |
