相对于免疫法，质谱方法定量蛋白质具有更好的特异性，能较好地克服自身抗体干扰、抗体试剂批间差的问题，能区分由突变、可变剪接和翻译后修饰等形成的蛋白质变体（proteoform），很好地弥补了基于抗原抗体结合的免疫法的不足，加上多重检测的优势，质谱法已成为蛋白质组学研究的一大利器。在临床实验室，无论从检测项目的数量或临床实验室的普及度来说，当前质谱法定量蛋白的临床应用依然十分有限，主要的挑战可能来源于方法开发和验证过程复杂、自动化程度低等方面。但质谱法的优势和价值是不可否认的，用质谱法检测甲状腺球蛋白和单克隆免疫球蛋白（M蛋白）是经典案例，充分体现了质谱检测的特异度和灵敏度优势。为了让质谱法进一步发挥其临床应用价值，我们该如何选择蛋白质类标志物并为之建立质谱检测方法？
近期，荷兰Leiden大学医学中心临床化学和实验室医学部门的研究者 Nico P M Smit及其同事在Journal of the American Society for Mass Spectrometry杂志上发表文章，题为The Time Has Come for Quantitative Protein Mass Spectrometry Tests That Target Unmet Clinical Needs。文章中以“自底向上”（bottom-up）蛋白定量策略为例，探讨了临床实验室如何选择蛋白质标志物并为之建立稳健的质谱定量方法，将整个过程分为四个阶段，提出了每个阶段的行动内容，见表1。最后，作者以自家实验室建立并运行的血清多种载脂蛋白定量方法为例，展示了该方法在四年时间里保持良好的分析性能和稳健性，以此表明蛋白定量质谱方法的临床应用值得更多信心，体外诊断产业、实验室专家、临床医生等应该齐心协力，共同推动蛋白质定量质谱的临床应用。
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